Фамилия Тимошенко относится к числу фамилий, основой которым послужили крестильные мужские имена восточных славян. На Украине каноническое церковное имя Тимофей, которое в переводе с древнегреческого языка означает "почитающий Бога", обычно употреблялось в народных формах Тимох и Тимош.

Так, например, во времена Богдана Хмельницкого (1649 г.) в "Реестре Войска Запорожского" упоминаются: Тимох Вергуненко и Тимох Антонович, казаки Черкасского полка; Тимох Кувезенко, казак Киевского полка, Тимох Сокира, казак Переяславского полка и 170 казаков, носящих имя Тимош (есть и один Тимохвей!). Разумеется, в такой форме это имя было популярным не только в среде казачества, ср.: Тимош Верховый, овручский крестьянин, 1683 г.; Тимош Непейко, брацлавский мещанин, 1639 г. По принятым в этих говорах правилам, семейное прозвание, образованное от обеих народных форм, звучало как Тимошенко. Например, в том же Реестре упоминаются более 90 казаков, носящих фамилию Тимошенко. А по подсчётам замечательного украинского исследователя Ю.К. Редько, произведённым им в 60-х годах прошлого века, фамилия Тимошенко получила наибольшее распространение в Донецкой, Киевской, Кировоградской, Одесской, Сумской, Харьковской и Волынской областях.